בראש המחלקה עומד ד"ר יונתן ישעיהו. האח האחראי הוא אילן בר-לב. לצידם, עובדים רופאים בכירים, מומחים ברפואת ילדים ועם התמחויות-על שונות כגון: אנדוקרינולוגית ילדים, סוכרת נעורים, ריאות ילדים, גסטרו ילדים, נוירולוגיה ילדים, קרדיולוגיה ילדים, המטולוגיה, אונקולוגית ילדים, מחלות זיהומיות, נפרולוגיה ועוד.
לצד הרופאים המומחים, עובדים במחלקה גם רופאים מתמחים וצוות סיעודי בעלי ניסיון רב בטיפול בילדים וצוות מסייע במגוון תחומים ובהם: פסיכולוגיה, קלינאות תקשורת, ריפוי בעיסוק, פיזיותרפיה, טיפול באומנות תזונה ועוד. כמו כן, פועלים במחלקה גם ליצנים רפואיים ומתנדבים, כדי לעודד את מצב רוחם של הילדים ולהקל עליהם את השהות במקום ואת ההתמודדות עם ההליכים השונים.
צוות המחלקה עובד בשיתוף פעולה מלא עם רופאי הקהילה, שמשתתפים במידת הצורך בהחלטות הטיפוליות כדי להבטיח את הרצף הטיפולי הנדרש. בפעילות המחלקה לוקחים חלק סטודנטים ומתמחים לצורך טיפוח הדור הבא של רופאי הילדים בישראל וקידום הידע הרפואי בנושא.