בדיקות הדמיה פולשנית המבוצעות במכון האנגיוגרפיה בבית החולים כרוכות, על פי רוב, בדקירה בודדת בלבד ומתבצעות תחת הרדמה מקומית או טשטוש קל. לעתים ההליך מצריך אשפוז, ולעתים ניתן להשתחרר לאחריו הביתה ללא צורך בשהייה ממושכת בבית החולים, בהתאם למצב הנבדק ולסוג הטיפול לו הוא זקוק. על ההליכים הרבים המבוצעים במכון נמנים:
- אנגיוגרפיה עם צנתר שמסייעת בבדיקת כלי דם במקומות שונים בגוף כגון גפיים תחתונות ועליונות, כולל צנתור של נצור (פיסטולה) עורקי-ורידי לדיאליזה, בטן ועוד. הצנתור מסייע לאבחן ולטפל בכלי הדם או באיברים אליהם הם מגיעים
- הכנסת נקזים וצינורות לצורך ניקוז מורסות (קולקציות), הכנסת נפרוסטומיות (נקז בכליה) ונקזים בדרכי מרה
- הכנסת צנתורים ורידיים שדרכם מקבלים טיפולים תוך ורידיים כמו טיפול אנטיביוטי ממושך, כימותרפיה, הזנה תוך ורידית ועוד
- עצירת דימומים מכלי דם שונים בגוף
- טיפול במפרצות של העורקים כולל אבי העורקים מבלי צורך בפתיחת בטן
- טיפולים מתקדמים בגידולים – אבלציה (צריבה) מקומית או הזרקת חומר כימי או רדיואקטיבי לתוך העורק המזין את הגידול
- ביופסיות מאיברים ומרקמות שונים ועוד