המחלקה פועלת החל מחודש אוקטובר 2017 ומעניקה מגוון רחב של שירותי רפואה לנשים במהלך הריונן. במחלקת האשפוז במקום מטופלות נשים בהריון הזקוקות למעקב צמוד.
במסגרת המחלקה, עומד לרשות המטופלות גם מכון אמבולטורי לרפואת האם והעובר הפועל כחלק ממערך מרפאות החוץ בבית החולים, ומעניק שירותים למטופלות המופנות אליו.
כמו כן, פועלת במסגרת המחלקה יחידת אולטרסאונד מיילדותי וגינקולוגי בה ניתנים מגוון שירותים בתחום ובהם בדיקות שקיפות עורפית, סקירת מערכות, דיקורי מי שפיר ועוד.
המערך למיילדות ולגינקולוגיה מסונף לבית הספר לרפואה של אוניברסיטת בן גוריון בבאר שבע, על מנת לקדם את המחקר בתחומו ולטפח את דור הרפואה הבא בישראל.