לפני כל טיפול בחולה חדש מכונס פורום מיוחד של אנשי מקצוע ממגוון תחומים, כולל מאסותא רמת החייל, כדי להחליט ביחד מהי הדרך הטובה ביותר לטפל במקרה.
הטיפולים שמוצעים במכון מאפשרים כיסוי מרבי של הגידולים והאיברים החולים, לצד מזעור חשיפה לאיברים הסמוכים. לשם כך, המטופלים עוברים הערכה מקיפה לפני הטיפול, הכוללת שימוש באמצעי הדמייה אשר מסייעים לרופאים לצורך הגדרה מדויקת של המוקדים שיקבלו קרינה מקסימלית. גם במהלך הטיפול נעשים צילומי רנטגן ו-CT על מיטת הטיפולים על מנת לוודא כי מה שתוכנן ומה שמתקיים בפועל זהה.
במהלך הטיפול הקרינתי החולים נמצאים במעקב צמוד של הצוות הסיעודי והרפואי והטכני, מקבלים הדרכה על מצבם הנוכחי ועל מה שצפוי תוך כדי הטיפול ולאחריו.